Kafka Streams with ML

Machine LearningStream Processing
, , ,

参考

kaiwaehner kafka-streams-machine-learning-examples

メモ

kaiwaehner/kafka-streams-machine-learning-examples

kaiwaehner kafka-streams-machine-learning-examples には、TensorFlow、Keras、H2O、Python、DL4JをKafka Streamsと併用するサンプルが含まれている。

上記レポジトリのREADMEには、いくつか参考文献が記載されている。

How to Build and Deploy Scalable Machine Learning in Production with Apache Kafka には、

  • デザインの概略みたいなものが載っていた
  • 学習と推論のモデルやりとりをどうつなぐのか？の考察

が記載されていた。

Using Apache Kafka to Drive Cutting-Edge Machine Learning にはモデルの組み込み方の種類、 AutoMLとの組み合わせについて考察（Not 具体例）が掲載されている。

Machine Learning with Python, Jupyter, KSQL and TensorFlow には、以下のような記述がある。 いつもの論文とセット。

Impedance mismatch between data scientists, data engineers and production engineers

これを解決する手段としていくつか例示。

  • ONNX、PMMLなどを利用
  • DL4Jなど開発者視点の含まれるプロダクトの利用
  • AutoML
  • モデルを出力してアプリに埋め込んで利用（TensorFlowだったらJava APIでモデルを利用する、など）
  • パブリッククラウドのマネージドサービス利用

ConfluentのKafka Python KSQL APIを使い、Jupyter上でKafkaからデータロードし分析する例も記載されていた。

kaiwaehner ksql-udf-deep-learning-mqtt-iot には、UDF内でTensorFlowを使う例が記載されている。

kaiwaehner ksql-fork-with-deep-learning-function には、エンドツーエンドで動作を確認してみるためのサンプル実装が載っている。

kaiwaehner tensorflow-serving-java-grpc-kafka-streams には、gRPC経由でKafka StreamsとTensorFlow Servingを連係する例が記載されている。

Convolutional Neural Network (CNN) with TensorFlow for Image Recognition

com.github.megachucky.kafka.streams.machinelearning.Kafka_Streams_TensorFlow_Image_Recognition_Example クラスを確認する。

概要

  • 本クラスは、予め学習されたTensorFlowのモデルを読み出して利用する
  • 上記モデルを利用するときには、TensorFlowのJava APIを利用する
  • 画像はどこかのストレージに保存されている前提となっており、そのPATHがメッセージとしてKafkaに入ってくるシナリオである
  • 画像に対するラベルのProbabilityを計算し、最大のProbabilityを持つラベルを戻り値として返す

詳細メモ

main内では特別なことはしていない。トポロジを組み立てるための getStreamTopology が呼ばれる。

getStreamTopology メソッドを確認する。

当該メソッドでは、最初にモデル本体やモデルの定義が読み込まれる。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/Kafka_Streams_TensorFlow_Image_Recognition_Example.java:83

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String modelDir = "src/main/resources/generatedModels/CNN_inception5h";

Path pathGraph = Paths.get(modelDir, "tensorflow_inception_graph.pb");
byte[] graphDef = Files.readAllBytes(pathGraph);

Path pathModel = Paths.get(modelDir, "imagenet_comp_graph_label_strings.txt");
List<String> labels = Files.readAllLines(pathModel, Charset.forName("UTF-8"));

続いてストリームのインスタンスが生成される。 その後、ストリーム処理の内容が定義される。

最初はメッセージ内に含まれる画像のPATHを用いて、実際の画像をバイト列で読み出す。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/Kafka_Streams_TensorFlow_Image_Recognition_Example.java:104

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KStream<String, Object> transformedMessage =
imageInputLines.mapValues(value ->  {

	String imageClassification = "unknown";
	String imageProbability = "unknown";

	String imageFile = value;

	Path pathImage = Paths.get(imageFile);
	byte[] imageBytes;
	try {
		imageBytes = Files.readAllBytes(pathImage);

つづいていくつかのヘルパメソッドを使って、画像に対するラベル（推論結果）を算出する。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/Kafka_Streams_TensorFlow_Image_Recognition_Example.java:117

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try (Tensor image = constructAndExecuteGraphToNormalizeImage(imageBytes)) {
	float[] labelProbabilities = executeInceptionGraph(graphDef, image);
	int bestLabelIdx = maxIndex(labelProbabilities);

	imageClassification = labels.get(bestLabelIdx);

	imageProbability = Float.toString(labelProbabilities[bestLabelIdx] * 100f);

	System.out.println(String.format("BEST MATCH: %s (%.2f%% likely)", imageClassification,
			labelProbabilities[bestLabelIdx] * 100f));
}

constructAndExecuteGraphToNormalizeImage メソッドは、グラフを構成し、前処理を実行する。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/Kafka_Streams_TensorFlow_Image_Recognition_Example.java:171

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final Output input = b.constant("input", imageBytes);
final Output output = b
		.div(b.sub(
				b.resizeBilinear(b.expandDims(b.cast(b.decodeJpeg(input, 3), DataType.FLOAT),
						b.constant("make_batch", 0)), b.constant("size", new int[] { H, W })),
				b.constant("mean", mean)), b.constant("scale", scale));
try (Session s = new Session(g)) {
	return s.runner().fetch(output.op().name()).run().get(0);
}

executeInceptionGraph メソッドは、予め学習済みのモデルと画像を引数にとり、 ラベルごとのProbabilityを算出する。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/Kafka_Streams_TensorFlow_Image_Recognition_Example.java:184

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try (Graph g = new Graph()) {

	// Model loading: Using Graph.importGraphDef() to load a pre-trained Inception
	// model.
	g.importGraphDef(graphDef);

	// Graph execution: Using a Session to execute the graphs and find the best
	// label for an image.
	try (Session s = new Session(g);
			Tensor result = s.runner().feed("input", image).fetch("output").run().get(0)) {
		final long[] rshape = result.shape();
		if (result.numDimensions() != 2 || rshape[0] != 1) {
			throw new RuntimeException(String.format(
					"Expected model to produce a [1 N] shaped tensor where N is the number of labels, instead it produced one with shape %s",
					Arrays.toString(rshape)));
		}
		int nlabels = (int) rshape[1];
		return result.copyTo(new float[1][nlabels])[0];
	}
}

executeInceptionGraph メソッドにより、ある画像に対するラベルごとのProbabilityが得られた後、 最大のProbabilityを持つラベルを算出。 それを戻り値とする。

Iris Prediction using a Neural Network with DeepLearning4J (DL4J)

Iris Prediction using a Neural Network with DeepLearning4J (DL4J) を確認する。

com.github.megachucky.kafka.streams.machinelearning.models.DeepLearning4J_CSV_Model_Inference クラスを確認したが、これはKafka Streamsアプリには見えなかった。 中途半端な状態で止まっている？ これをベースに Kafka Streams のアプリを作ってみろ、ということか。

もしくはunitテスト側を見ろ、ということか？ -> そのようだ。 Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java

クラスの内容を確認する。

まずテストのセットアップ。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:46

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@ClassRule
public static final EmbeddedKafkaCluster CLUSTER = new TestEmbeddedKafkaCluster(1);

private static final String inputTopic = "IrisInputTopic";
private static final String outputTopic = "IrisOutputTopic";

// Generated DL4J model
private File locationDL4JModel = new File("src/main/resources/generatedModels/DL4J/DL4J_Iris_Model.zip");

// Prediction Value
private static String irisPrediction = "unknown";

TestEmbeddedKafkaClusterはテスト用のKafkaクラスタを起動するヘルパークラス。 内部的には、Kafka Streamsのテストに用いられている補助機能である org.apache.kafka.streams.integration.utils.EmbeddedKafkaCluster クラスを継承して作られている。

機械学習モデルは、予め学習済みのものが含まれているのでそれを読み込んで用いる

テストコードの実態は、 com.github.megachucky.kafka.streams.machinelearning.test.Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest#shouldPredictIrisFlowerType である。 以降、当該メソッド内を確認する。

メソッドの冒頭で、Kafka Streamsの設定を定義している。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:67

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		// Iris input data (the model returns probabilities for input being each of Iris
		// Type 1, 2 and 3)
		List<String> inputValues = Arrays.asList("5.4,3.9,1.7,0.4", "7.0,3.2,4.7,1.4", "4.6,3.4,1.4,0.3");

(snip)

		streamsConfiguration.put(StreamsConfig.DEFAULT_KEY_SERDE_CLASS_CONFIG, Serdes.String().getClass().getName());
		streamsConfiguration.put(StreamsConfig.DEFAULT_VALUE_SERDE_CLASS_CONFIG, Serdes.String().getClass().getName());

このサンプルは動作確認用のため簡易な設定になっている。 実際のアプリケーション開発時にはきちんと設定必要。

なお、途中でDL4Jのモデルを読み込んでいる。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:86

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// Create DL4J object (see DeepLearning4J_CSV_Model.java)
MultiLayerNetwork model = ModelSerializer.restoreMultiLayerNetwork(locationDL4JModel);

その後、ビルダのインスタンスを生成し、Irisデータを入力とするストリームを定義する。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:97, 104 

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final StreamsBuilder builder = new StreamsBuilder();
final KStream<String, String> irisInputLines = builder.stream(inputTopic);

その後はストリームのメッセージに対し、DL4Jのモデルによる推論を実行する。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:108

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irisInputLines.foreach((key, value) -> {

	if (value != null && !value.equals("")) {
		System.out.println("#####################");
		System.out.println("Iris Input:" + value);

		// TODO Easier way to map from String[] to double[] !!!
		String[] stringArray = value.split(",");
		Double[] doubleArray = Arrays.stream(stringArray).map(Double::valueOf).toArray(Double[]::new);
		double[] irisInput = Stream.of(doubleArray).mapToDouble(Double::doubleValue).toArray();

		// Inference
		INDArray input = Nd4j.create(irisInput);
		INDArray result = model.output(input);

		System.out.println("Probabilities: " + result.toString());

		irisPrediction = result.toString();

	}

});

ここでは入力されたテキストデータをDouble型の配列に変換し、さらにND4JのINDArrayに変換する。 それをモデルに入力し、推論を得る。

その後、テキストを整形し、出力用トピックに書き出し。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:132 

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// Transform message: Add prediction information
KStream<String, Object> transformedMessage = irisInputLines
		.mapValues(value -> "Prediction: Iris Probability => " + irisPrediction);

// Send prediction information to Output Topic
transformedMessage.to(outputTopic);

ビルダを渡し、ストリーム処理をスタート。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:140 

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final KafkaStreams streams = new KafkaStreams(builder.build(), streamsConfiguration);
streams.cleanUp();
streams.start();
System.out.println("Iris Prediction Microservice is running...");
System.out.println("Input to Kafka Topic 'IrisInputTopic'; Output to Kafka Topic 'IrisOutputTopic'");

その後、これはテストコードなので、入力となるデータをアプリケーション内で生成し、入力トピックに書き込む。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_MachineLearning_DL4J_DeepLearning_Iris_IntegrationTest.java:149 

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Properties producerConfig = new Properties();
producerConfig.put(ProducerConfig.BOOTSTRAP_SERVERS_CONFIG, CLUSTER.bootstrapServers());
producerConfig.put(ProducerConfig.ACKS_CONFIG, "all");
producerConfig.put(ProducerConfig.RETRIES_CONFIG, 0);
producerConfig.put(ProducerConfig.KEY_SERIALIZER_CLASS_CONFIG, StringSerializer.class);
producerConfig.put(ProducerConfig.VALUE_SERIALIZER_CLASS_CONFIG, StringSerializer.class);
IntegrationTestUtils.produceValuesSynchronously(inputTopic, inputValues, producerConfig, new MockTime());

ここでは結合テスト用のヘルパーメソッドを利用。

その後、出力トピックから結果を取り出し、確認する。（実装解説は省略）

Python + Keras + TensorFlow + DeepLearning4j

例のごとく、テスト側が実装本体。 Kafka_Streams_TensorFlow_Keras_Example_IntegrationTest クラスを確認する。

実態は shouldPredictValues メソッド。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_TensorFlow_Keras_Example_IntegrationTest.java:64

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public void shouldPredictValues() throws Exception {

上記メソッド内では、最初にモデルを読み込む。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_TensorFlow_Keras_Example_IntegrationTest.java:69

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String simpleMlp = new ClassPathResource("generatedModels/Keras/simple_mlp.h5").getFile().getPath();
System.out.println(simpleMlp.toString());

MultiLayerNetwork model = KerasModelImport.importKerasSequentialModelAndWeights(simpleMlp);

上記では、HDF形式で予め保存されたモデルを読み込む。 読み込みの際にはDeeplearning4Jの KerasModelImport#importKerasSequentialModelAndWeights メソッドが用いられる。

続いて、Kafka Streamsのコンフィグを定める。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_TensorFlow_Keras_Example_IntegrationTest.java:81

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Properties streamsConfiguration = new Properties();
streamsConfiguration.put(StreamsConfig.APPLICATION_ID_CONFIG,
		"kafka-streams-tensorflow-keras-integration-test");
streamsConfiguration.put(StreamsConfig.BOOTSTRAP_SERVERS_CONFIG, CLUSTER.bootstrapServers());

streamsConfiguration.put(StreamsConfig.DEFAULT_KEY_SERDE_CLASS_CONFIG, Serdes.String().getClass().getName());
streamsConfiguration.put(StreamsConfig.DEFAULT_VALUE_SERDE_CLASS_CONFIG, Serdes.String().getClass().getName());

次にKafka Streamsのビルダを定義し、入力トピックを渡して入力ストリームを定義する。

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final StreamsBuilder builder = new StreamsBuilder();

final KStream<String, String> inputEvents = builder.stream(inputTopic);

以降、メッセージを入力とし、推論を行う処理の定義が続く。

先程定義したストリームの中は、カンマ区切りのテキストになっている。 これをカンマで区切り、配列に変換する。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_TensorFlow_Keras_Example_IntegrationTest.java:104

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inputEvents.foreach((key, value) -> {

	// Transform input values (list of Strings) to expected DL4J parameters (two
	// Integer values):
	String[] valuesAsArray = value.split(",");
	INDArray input = Nd4j.create(Integer.parseInt(valuesAsArray[0]), Integer.parseInt(valuesAsArray[1]));

配列への変換には、Nd4Jを用いる。

配列の定義が完了したら、それを入力としてモデルを用いた推論を行う処理を定義する。

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	output = model.output(input);
	prediction = output.toString();

});

最後は出力メッセージに変換し、出力トピックへの書き出しを定義する。 その後、独自のユーティリティクラスを使って、ビルダーに基づいてストリームをビルド。 ストリーム処理を開始する。

com/github/megachucky/kafka/streams/machinelearning/test/Kafka_Streams_TensorFlow_Keras_Example_IntegrationTest.java:118

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// Transform message: Add prediction result
KStream<String, Object> transformedMessage = inputEvents.mapValues(value -> "Prediction => " + prediction);

// Send prediction result to Output Topic
transformedMessage.to(outputTopic);

// Start Kafka Streams Application to process new incoming messages from
// Input Topic
final KafkaStreams streams = new TestKafkaStreams(builder.build(), streamsConfiguration);
streams.cleanUp();
streams.start();
System.out.println("Prediction Microservice is running...");
System.out.println("Input to Kafka Topic " + inputTopic + "; Output to Kafka Topic " + outputTopic);
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